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技术文章

可溶性蛋白OD普遍偏低逐项排查

现象:标准曲线正常,但所有植物样品OD都很低,接近空白,算出来蛋白含量远低于文献预期。

1、研磨不充分(最常见)

原因:植物纤维多,液氮研磨没磨成细粉末,组织还是小颗粒,蛋白释放不完全。

? ?错误:只捣几下,组织呈碎块;液氮挥发完才研磨。

? ?解决:
1)样品加液氮,充分磨成细腻白色粉末,看不到小组织碎片;
2)磨好后,在液氮还没完全挥发前快速加预冷提取液;
3)老叶、木质化根要增加研磨时间;可以加少量石英砂助磨。

2、蛋白降解

原因:取样、研磨、提取过程温度太高,内源蛋白酶水解蛋白。

? 风险点:室温操作;研磨完回温慢;离心温度不是4℃;样品放置很久才测。

? ?解决:
1)全部提取步骤冰上/4 ℃操作;
2)提取缓冲液可以加蛋白酶抑制剂PMSF(现加,终浓度1?mM);
3)离心完上清尽快测,不要放室温,暂存放?20℃;反复冻融要避免。
β?巯基乙醇主要抗氧化,不能抑制蛋白酶,只加它挡不住降解。
3、提取缓冲液pH不对

Bradford染料结合蛋白对pH敏感;植物蛋白大多中性偏酸,pH偏离7.0?7.4会降低提取效率、降低显色。

? ?问题:PBS配错pH;缓冲液久放pH漂移。

? ?解决:
1)校准pH计,提取缓冲液严格调到 pH 7.2左右;
2)不要用纯水代替缓冲液提取,纯水蛋白溶出很差。
注意:高浓度Tris也会干扰Bradford显色,尽量用PBS体系。
4、样品量太少

? 情况:取样鲜重过小;或者提取液加太多,稀释倍数过大。
举例:0.1?g叶片,加5?mL提取液,蛋白被过度稀释,OD压到接近空白。

? ?调整:
叶片推荐:0.2?0.5 g鲜重 + 1?3 mL提取缓冲液(1:5 ~1:10 w/v);
如果材料珍贵不能多加样,减少提取液体积,提高蛋白终浓度。

额外容易忽略2个隐性原因(也会造成OD低)

1. PVP加太多:高浓度PVP会轻微干扰Bradford显色,PVP?40建议1%即可,不要盲目加高。

2. 取样部位问题:衰老叶片、木质化老根本身可溶性蛋白本底就很低,不是操作问题,属于材料本身。
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